雖然生物共振儀在部分地區(qū)被廣泛使用，但其科學(xué)有效性存在巨大爭議。

缺乏臨床證據(jù)：目前主流醫(yī)學(xué)界認(rèn)為其原理缺乏嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)依據(jù)。多個研究指出，該設(shè)備難以區(qū)分不同的物質(zhì)或生物體，其測量結(jié)果往往具有極高的主觀性和可重復(fù)性差。

監(jiān)管狀態(tài)：由于缺乏科學(xué)驗證，部分國家的監(jiān)管機構(gòu)已對其進行警告或限制。例如，中國曾因缺乏依據(jù)而叫停了相關(guān)產(chǎn)品的注冊。

安全性：盡管被標(biāo)榜為“無副作用”，但由于其基于電磁場，使用時仍需謹(jǐn)慎，避免在有心臟起搏器等電子植入物的患者身上使用。