編號

名稱

規(guī)格

單位

服務(wù)廠家

備注

1

引物合成 --2OD

ULTRPAGE級***D

bP

上海生工

2

引物合成 --5OD

ULTRPAGE級***D

bP

3

兼并堿基 Ⅰ合成--2OD

ULTRPAGE級***D

bP

上海生工

4

兼并堿基 Ⅰ合成--5OD

ULTRPAGE級***D

bP

5

探針標記 --2OD

ULTRPAGE級***D

條

6

探針標記 --5OD

ULTRPAGE級***D

條

上海生工或指定廠家

7

亞克隆

上海生工或指定廠家

8

序列測定

***BP/反應(yīng)

反應(yīng)

昆泰銳或指定廠家

9

毛細管電泳測序

***孔/板

板

上海生工或指定廠家

***

細菌全基因組測序

測序深度 ***X以上，Q***值大于***%

株

諾禾

文庫構(gòu)建 +上機測序

***

細菌全基因組測序（拼接）

測序深度 ***X以上，Q***值大于***%

株

諾禾

文庫構(gòu)建 +上機測序+完整基因組拼接

***

HIV-1病毒耐藥一代測序

***BP/反應(yīng)

反應(yīng)

1、接受中國疾控中心考核，成績?yōu)閮?yōu)秀的測序公司；2、與中國CDC有耐藥檢測項目業(yè)務(wù)的專業(yè)測序公司

測序公司：北京諾賽基因或研究人員指定廠家

***

HIV-1病毒耐藥檢測服務(wù)

病例

個

1、接受中國疾控中心考核，成績?yōu)閮?yōu)秀的測序公司；2、與中國CDC有耐藥檢測項目業(yè)務(wù)的專業(yè)測序公司

測序公司：北京諾賽基因或研究人員指定廠家

***

二代深度測序

培養(yǎng)物標本： 1、二代illumina NovaSeq/HiseqX Ten平臺，要求PE***雙端測序，PCR free建庫、測序、生信分析和最終的分析報告（報告內(nèi)容根據(jù)客戶需求而定）；2、Q***≥***%,測序深度大于***X，樣本組裝的基因組覆蓋率超過***%

株

與在研人員協(xié)商，共同指定測序公司

測序公司：上海伯杰醫(yī)療科技有限公司或研究人員指定廠家

***

二代深度測序

臨床標本： 1、二代illumina NovaSeq/HiseqX Ten平臺，要求PE***雙端測序，PCR free建庫、測序、生信分析和最終的分析報告（報告內(nèi)容根據(jù)客戶需求而定）；2、Q***≥***%,測序深度大于***X，樣本組裝的基因組覆蓋率超過***%

份

與在研人員協(xié)商，共同指定測序公司

此價格為一份樣品測一次序列的價格。測序公司：上海伯杰醫(yī)療科技有限公司或研究人員指定廠家

***

三代深度測序

臨床標本： 1、Pacbio sequel平臺，樣本需要分析甲基化情況，單分子全長測序，要求PCR free建庫、測序、生信分析和最終的分析報告。

份

與在研人員協(xié)商，共同指定測序公司

研究人員指定廠家

***

流感毒株一代測序

1個片斷全序（至少測序8個反應(yīng)）

株

與在研人員協(xié)商，共同指定測序公司

測序公司：上海伯杰醫(yī)療科技有限公司或研究人員指定廠家

***

流感毒株一代測序

8個片段全序（每個片段至少測序8個反應(yīng)）

株

與在研人員協(xié)商，共同指定測序公司

測序公司：上海伯杰醫(yī)療科技有限公司或研究人員指定廠家

***

RNA病毒宏基因組測序

1.樣品類型：拭子 ，糞便、唾液、血液、腸道內(nèi)容物等樣品。2測序類型：高通量二代測序（包含：病毒RNA提取、建庫、測序、數(shù)據(jù)分析全流程。）3.數(shù)據(jù)量:6G ???4：數(shù)據(jù)分析：a、數(shù)據(jù)質(zhì)控（低質(zhì)量reads過濾、adaptor過濾、宿主過濾） b 、基因組組裝。 c、基因預(yù)測、去冗余。d、基因豐度統(tǒng)計：樣本基因數(shù)目統(tǒng)計、core-pan基因稀釋曲線、基因數(shù)目差異分析（組間基因數(shù)目差異箱圖、Venn圖/花瓣圖）、基因數(shù)目的樣品間相關(guān)性分析。e、物種注釋及統(tǒng)計：物種豐度概況、注釋基因數(shù)目及相對豐度聚類分析、基于物種豐度的降維分析、基于物種豐度的Bray-Curtis距離的降維分析、基于物種豐度的Anosim分析、基于物種豐度的樣品聚類分析、組間差異物種的 Metastat分析、組間差異物種的LEfSe分析、隨機森林分析，f、功能注釋及統(tǒng)計：KEGG、eggNOG、CAZy。g、功能豐度統(tǒng)計：功能相對豐度概況、功能相對豐度聚類分析、基于功能豐度的降維分析、基于功能豐度的Bray-Curtis距離的降維分析、基于功能豐度的Anosim分析、基于功能豐度的樣品聚類分析。g、代謝通路比較分析：代謝通路比較分析、代謝通路注釋基因數(shù)目及差異EC分析。h、組間功能差異的Metastat分析、組間功能差異的LEfSe分析。i、抗性基因注釋：抗性基因豐度概況、抗性基因類型的分布及豐度聚類分析、組間抗性基因數(shù)目差異分析、抗性基因與物種歸屬關(guān)系利用高通量測序技術(shù)得到病毒核酸的片段序列，通過后續(xù)生物信息分析，研究病毒的物種分布、相對豐度，以及預(yù)測新病毒。

份

伯杰

***

DNA病毒宏基因組測序

1.樣品類型：拭子、糞便、唾液、血液、腸道內(nèi)容物等樣品。2測序類型：高通量二代測序（包含：病毒DNA提取、建庫、測序、數(shù)據(jù)分析全流程。）3.數(shù)據(jù)量 ***G 4：數(shù)據(jù)分析：a、數(shù)據(jù)質(zhì)控（低質(zhì)量reads過濾、adaptor過濾、宿主過濾） b 、基因組組裝。 c、基因預(yù)測、去冗余。d、基因豐度統(tǒng)計：樣本基因數(shù)目統(tǒng)計、core-pan基因稀釋曲線、基因數(shù)目差異分析（組間基因數(shù)目差異箱圖、Venn圖/花瓣圖）、基因數(shù)目的樣品間相關(guān)性分析。e、物種注釋及統(tǒng)計：物種豐度概況、注釋基因數(shù)目及相對豐度聚類分析、基于物種豐度的降維分析、基于物種豐度的Bray-Curtis距離的降維分析、基于物種豐度的Anosim分析、基于物種豐度的樣品聚類分析、組間差異物種的 Metastat分析、組間差異物種的LEfSe分析、隨機森林分析，f、功能注釋及統(tǒng)計：KEGG、eggNOG、CAZy。g、功能豐度統(tǒng)計：功能相對豐度概況、功能相對豐度聚類分析、基于功能豐度的降維分析、基于功能豐度的Bray-Curtis距離的降維分析、基于功能豐度的Anosim分析、基于功能豐度的樣品聚類分析。g、代謝通路比較分析：代謝通路比較分析、代謝通路注釋基因數(shù)目及差異EC分析。h、組間功能差異的Metastat分析、組間功能差異的LEfSe分析。i、抗性基因注釋：抗性基因豐度概況、抗性基因類型的分布及豐度聚類分析、組間抗性基因數(shù)目差異分析、抗性基因與物種歸屬關(guān)系利用高通量測序技術(shù)得到病毒核酸的片段序列，通過后續(xù)生物信息分析，研究病毒的物種分布、相對豐度，以及預(yù)測新病毒。

份

伯杰

***

細菌宏基因組測序

1.樣品類型：拭子 、糞便、唾液、血液、腸道內(nèi)容物等樣品。2測序類型：高通量二代測序（包含：細菌DNA提取、建庫、測序、數(shù)據(jù)分析全流程。）3.數(shù)據(jù)量 ***G 4：數(shù)據(jù)分析：原始數(shù)據(jù)+高質(zhì)量數(shù)據(jù)+基于非拼接序列的物種注釋+ 序列拼接+基于拼接序列的物種注釋+基因預(yù)測+蛋白功能注釋+物種組成譜分析+功能水平分析

伯杰

***

轉(zhuǎn)錄組測序

1.樣品類型 組織、細胞等。2測序類型：高通量二代測序（包含：病毒DNA提取、建庫、測序、數(shù)據(jù)分析全流程。）3.數(shù)據(jù)量 6G 4：數(shù)據(jù)分析：細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有mRNA轉(zhuǎn)錄組測序能夠全面解析mRNA信息，同時獲得樣本的轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄豐度信息探究疾病相關(guān)基因結(jié)構(gòu)變異挖掘差異表達基因分析致病機制，從整體水平研究基因表達量以及基因結(jié)構(gòu)，揭示特定生物學(xué)過程中的分子機理.

用戶指定

***

呼吸道病原微生物靶向高通量基因檢測

1.樣品類型：拭子 ，糞便、唾液、血液、腸道內(nèi)容物等樣品。2.鑒定內(nèi)容：鑒定臨床常見的***種病原微生物、耐藥基因、毒力基因包括：革蘭氏陽性菌***種、革蘭氏陰性菌***種、DNA病毒***種、RNA病毒***種、真菌***種、其他病原體（支原體、衣原體等 ）***種、耐藥基因***種、毒力基因***種。3、檢測方式：靶向高通量測序

華大

***

呼吸道病原微生物靶向高通量基因檢測

1.樣品類型：拭子 ，糞便、唾液、血液、腸道內(nèi)容物等樣品。2.鑒定內(nèi)容：鑒定臨床常見的***種病原微生物、***種耐藥基因：革蘭氏陽性菌***種、革蘭氏陰性菌***種、DNA病毒***種、RNA病毒***種、真菌***種、分枝桿菌***種、支原體/衣原體/寄生蟲 ***種、耐藥基因***種。3、檢測方式：靶向高通量測序。4數(shù)據(jù)分析：a、提供原始測序數(shù)據(jù)。b、病原種類鑒定。c、病原豐度計算。d、耐藥基因鑒定

伯杰

***

蛋白質(zhì)質(zhì)譜

采用 4D-DIA基于timsTOFPro離子淌度平臺的4D-DIA技術(shù)，上機時間不低于***分鐘。提供差異蛋白功能分析，GO富集、KEGG富集、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)、GSEA富集等分析。

客戶指定廠家

***

擴增子測序

使用 Illumina Novaseq 主流高通量測序平臺進行 PE*** 測序；單樣本測序數(shù)據(jù)量（raw tags）為 5 萬條，單樣本交付數(shù)據(jù)量不少于承諾數(shù)據(jù)量的 ***％，要求原始數(shù)據(jù) Q***＞***%。QIIME2 流程，物種注釋（OTU 聚類及物種注釋概況）、物種分布情況（相對豐度、分類樹、熱圖等）、樣本復(fù)雜度分析(Alpha Diversity、物種多樣性曲線等)、多樣本比較分析(Beta Diversity、矩陣熱圖、降維分析等)、統(tǒng)計檢驗（組間差異分析、組間群落結(jié)構(gòu)差異顯著性檢驗（Anosim、 MRPP、 Adonis、 Amova）組間差異物種分析）、關(guān)聯(lián)分析與模型預(yù)測（環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析、 Network 分析、隨機森林）功能預(yù)測（PICRUST、 Tax4fun、 FAPROTAX、 FunGuild、 BugBase 分析）

份

客戶指定廠家

新增，以議標價格為準

***

宏基因組測序（ DNA+RNA）

1.樣品類型：拭子 、糞便、肺泡灌洗液、血液、腦脊液等樣品。2測序類型：高通量二代測序（包含：DNA+RNA提取、建庫、測序、數(shù)據(jù)分析全流程。）3.數(shù)據(jù)量≥ ***G。 5：數(shù)據(jù)分析：原始數(shù)據(jù)+高質(zhì)量數(shù)據(jù)+基于非拼接序列的物種注釋+ 序列拼接+基于拼接序列的物種注釋+基因預(yù)測+蛋白功能注釋+物種組成譜分析+功能水平分析

份

客戶指定廠家

新增，以議標價格為準

***

低豐度蛋白組測序分析

采用 dirECT DIA的定量分析，Astral平臺。1鑒定通量（***）種蛋白。數(shù)據(jù)分析包括（多肽鑒定，pca分析，go分析，kegg分析，venn分析，火山圖分析，PPI蛋白互作，亞細胞定位，生物標志物篩選

份

客戶指定廠家

新增，以議標價格為準

***

非靶代謝組學(xué) (LC-MS)測序分析

測試方法 LC-MS(QE/HF-X).鑒定通量（***種左右），主要包含（能量代謝類，氨基酸類，脂肪酸類，色氨酸類，多酚類，脂質(zhì)類）等相關(guān)小分子物質(zhì)。數(shù)據(jù)分析包括（pca分析，go分析，kegg分析，venn分析，火山圖分析）

份

客戶指定廠家

新增，以議標價格為準

***

靶向代謝測定

采用 LC-MS、ICS、HPLC、GC-MS等方法測序樣品中代謝物質(zhì)?？梢詸z測的代謝物質(zhì)種類包括： 氨基酸、維生素、脂肪酸、有機酸、類胡蘿卜素、花生四烯酸、糖代謝、類黃酮、生物堿、TCA膽汁酸、生物胺、神經(jīng)遞質(zhì)、TMAO、植物激素、單寧類、多酚類、花青素、糖等。

樣

客戶指定廠家

新增，以議標價格為準